目前菏澤東站圖定開通17對旅客列車,其中管內列車15對、直通列車2對、高峰線6對。
當前,菏澤高鐵連接的車站有,菏澤東、巨野北、莊寨、榮成、威海、牟平、煙臺南、萊陽、萊西、青州、淄博、濟南、濟南東、濟南西、曲阜東、曲阜南、濟寧東、濟寧北、北京南、泰安、淄博、濰坊、夏各莊、臨沂北、費縣北、蒙山、曲阜南、嘉祥北、青島機場、青島北、德州東、天津南、天津西、濱海西、濱海北、唐山、灤河、秦皇島、山海關、錦州南、臺安、沈陽北、四平東、長春西、德惠西、雙城北、哈爾濱西、安達、大慶西、齊齊哈爾南等